月季启动子序列中的顺式元件分析 - PenJing8
月季启动子序列中的顺式元件分析
2020-08-04 14:34:42  浏览:152
 2  月季 Rh OOMT2、Rh CCD4 和 Rh NUDX1 启动子序列中的顺式元件分析 
 
利用 FPNI-PCR 的方法获得 Rh OOMT2(图 3)、Rh CCD4(图 4)和 Rh NUDX1(图 5)的起始密码子上游的启动子序列,长度分别为 1 601、1 539 和 1 433 bp,Gen Bank 序列号分别为 MG940861、MG940862 和 MG940863。 


月季启动子序列中的顺式元件分析
 
在 Plant CARE 数据库(Lescot et al.,2002)中预测了 3 个启动子中的顺式元件。在 Rh OOMT2的启动子中(图 3),存在响应乙烯的 ERE 元件 1 个,响应 Me JA 的 CGTCA 元件和 TGACG 元件各2 个,包括 Box  4、Box  I 和 G-box 的光响应元件 5 个,响应干旱的 MBS 元件 2 个,响应真菌感染的 Box-W1 元件 1 个,厌氧诱导的 ARE 元件 2 个,胚乳表达相关的 GCN4_motif 和 Skn-1_motif 各2 个。 
 
在 Rh CCD4 的启动子(图 4)中,有响应赤霉素的 GARE 元件 1 个,响应水杨酸的 TCA 元件 1个,响应 ABA 的 ABRE 元件 1 个,以及响应 Me JA 的 CGTCA 元件和 TGACG 元件各 1 个,厌氧诱导的 ARE 元件 2 个,顶端分生组织特异的 CAT-box 元件 1 个,包括 G-Box、GT1-motif 和 MRE的光响应元件 4 个。 
 
在 Rh NUDX1 的启动子(图 5)中,存在响应 ABA 的 ABRE 元件 2 个,响应 Auxin 的  Aux RR-core元件 1 个,响应 Me JA 的 CGTCA 元件和 TGACG 元件共 10 个,包括 G-Box、Box 4、ACE 和 3-AF1的光响应元件 7 个,响应干旱的 MBS 元件 1 个,防御和胁迫响应的 TC-rich repeats 元件 1 个,种子特异表达的 RY-element 元件 2 个。