以根代干式盆景与露根式盆景的区别是:露根式盆景在保留原有树干的基础上提根，使其悬根露爪，根的形态不做改变，只作为观赏体的一部分;而以根代干式盆景的树干则完全被树根替代，根的观赏形态已不复存在，而是以干的形式出现。
以根代干式盆景所用的桩材应选择那些根部具有树干形态的树桩，对枝的要求不太严格。栽种时间可根据树种的不同而定，一般多在冬春季节，犹以春季萌芽前成活率最高。栽种前要对桩材进行修剪整形，剪去不需要的枝条，对过长的枝条适当截短，但对较粗的枝条应予以保留，以备以后造型的需要，并对树根进行修剪，然后栽入瓦盆养坯。
由于枸杞的树根上粗下细，提根后违背树木下粗上细的自然规律，可将其倒栽，也很容易成活，但长势较弱。树桩栽种宜深，最好能将根部全部埋入土中，如果花盆深度不够，可用油毡卷成筒套入花盆，然后填土，以增加盆土高度。
栽种时土要压实，浇透水。天气寒冷时应罩上透明的塑料袋进行防寒保温，新栽的植株放在避风向阳处养护，保持盆土湿润而不积水，活稳后去掉塑料袋。植株生长旺盛时施些腐熟的稀薄液肥，对枝条可任其生长，以通过叶片的光合作用，制造更多的养分，使树桩生长旺盛，根系发达。等冬季落叶后，将迎春、黄荆等树桩多余的枝条剪除，过长的枝条短截。而枸杞则要等春天即将萌芽时再修剪，否则会造成退枝(即所修剪的枝条枯死)。养护中应逐渐去掉部分盆土，为以后的提根做准备。