确定观赏面后最首要的是要把主干处理好，主干是树桩盆景的主线，是造型的关键，主干的变化决定了树木的姿态，主干加工处理得好，一件作品的美才能得到充分体现。自然界中的树木主干千姿百态，其中有的巍然挺拔、顶天立地，有的飘斜横出、宛如临水，有的曲屈跌岩、势若游龙，有的清瘦高耸、飘逸清奇，有的矮壮雄峰、古拙厚朴，归结起来可分为直干、斜干、曲干、卧干或单干、双干、多干，在盆景的表现形式上还有回头、捞月、挂壁等，马尾松除多干丛林桩头极为小见之外，其他形态都存在，并有不少奇特怪桩，有利于造型上的创新。
对马尾松桩头按最好观赏面选定主干后，可用截干蓄枝方法，选取经基部往上最有价值那一段进行截干，截到恰到好处。由于马尾松枝干不带针叶不萌发新芽，截口上端必须留有带针叶侧枝养粗延伸主干。老干如不是两边都有侧枝，截口要留长5公分左右，并用封口胶或草木灰封口，防止回缩或树液流失，等侧枝长旺再做加工修整。
对树桩盆景主干总的要求上自下而上过度自然、曲屈有度、富于变化、逐段缩小。应以观赏面为准，使干体以不同角度弯曲变化，且左右幅度大、前后幅度小，弯曲的角度和每段的长短都要富有变化，自然舒展、平衡协调，尽量呈现有动感、力感的曲线美，避免过于匀衡机械。缺乏变化又难以加工的直干可做成迎客松。对主干伸展姿态的造型加工，可使用简单工具，应有力学原理，取好弯曲角度，进行强力推顶拉吊。实践证明，直径四公分左右枝干一样可以强力舒弯，不必开沟或作契形切口。
操作过程注意保护好荒皮、受力的部位要设法垫妥。马尾松一本多干桩头极少、但可合栽，多干型除注意单干主干变化外，更应考虑整体效果，干与干的协调，主次呼应等，如双干的兄弟树、爷孙树、一直一斜、双飘斜等，三干以上各干不要并排一个平面，要有深度，有透视感，有组合，有顾盼。
马尾松盆景枝托的造型要求能根据其在自然界中的生长规律表现松树风格。不论哪种树型，都要曲屈有度，走势刚劲流畅，主枝平伸略显下垂，并有分级分枝，脉络清楚，形成枝片。可适当制作展示力度的硬角死曲和软角，直线和柔美曲线相结合，做到刚柔并做到刚柔并蓄，美而耐看。
由于马尾松老干极难萌发新芽，对原有桩头的枝托应充分考虑利用，特别是斜干的底托更为珍贵，能不缺托的尽量不缺，但不主张采用扭转迴旋勉强补位的所谓借托借枝。借托有时平面效果还似可以，但总是缺憾，出枝位置不对，经不起推敲，不耐看。