盆栽因根系生长有限，有时肥水和外界条件也难以满足，栽培品种更要适合，春季栽的要选秧蔓短小的，或者无蔓的小南瓜。夏栽的因为天气炎热蒸发量大，所以要选择植株生长势强的品种。
盆栽南瓜的栽植盆直径应在20～30厘米，小盆栽1株，大盆可以栽2株。盆底的孔不要太小，最好是“五花眼”，为利于透水，盆底要扣放弧形的瓦片。盆土要求有机质丰富和含有多种矿物营养。盆土的配制可参照营养钵育苗，以疏松肥沃、保水蓄肥力强为主。下面举几个例子，以供参考。
其一，取肥沃的沙壤田土，没种过瓜类作物的菜田、有机质丰富的农田疏松表层土40％，稻壳灰30％，过磷酸钙1％，人粪尿29％。先将土、过磷酸钙和稻壳搅和拌匀，然后分层泼上人粪尿，上面覆盖塑料薄膜，堆积发酵5～6个月，3个月时倒一次堆，最后粉细过筛装盆。
其二，取上述优质土壤40％，泥炭60％，混合粉细，过筛装盆。
其三，取上述优质土壤50％，骡马粪49％，过磷酸钙1％，掺匀堆积放在一起，浇上洗鱼、鸡的腥水，泼洒2～3次，淹透为止，然后用塑料薄膜覆盖发酵5～6个月，沤制3个月时翻一次堆，再继续发酵，然后粉细过筛装盆。
其四，取上述土壤40％，猪圈粪或作物秸秆堆肥59％，过磷酸钙1％，堆积发酵5～6个月，沤制3个月时翻堆再沤制，然后粉细过筛装盆。
其五，取上述土壤50％，鸡粪20％，堆肥30％，堆积沤制半年13个月时翻堆，再沤制，然后粉细过筛装盆。
盆栽南瓜最好育苗，方法同上述常规育苗。盆栽定植期根据保温条件而定，如果能保持生长所需要的温度，不受冻害，光照也充足，可早定植；否则要晚点再定植，一般可在断霜期前一个月定植。定植后，白天晴天，温度在10℃以上将盆搬出室外，晚上再移入室内，断霜后天气转暖可昼夜在室外生长。